Размышления Жоффруа о позвоночной теории черепа тесно связаны с изучением позвоночника и строения позвонка. Эти исследования привели Жоффруа к идее, что членистоногие являются также позвоночными, иначе говоря, что все животные, включая и беспозвоночных, принадлежат к одному морфологическому типу. Это был смелый скачок мысли, доставившей Жоффруа, как он сам пишет, большую радость, ибо казался ему невиданным дотоле синтезом. Однако, как мы сейчас увидим, это «открытие» оказалось фактически грубой ошибкой.
Свои взгляды по этому вопросу в общей форме Сент-Илер изложил в статье   1822 г.  под названием  «Общие представления о позвонке». Он подробно рассматривает позвонок камбалы и его вертикальные придатки, служащие опорой соответствующих непарных плавников: спинного и брюшного (см. рисунок). Жоффруа отмечает, что в середине тела позвонка рыб иногда имеется небольшое отверстие, которое он толкует, как след трубчатого строения тела позвонков. Такое строение он считает ясно выраженным в сегментах тела насекомых, раков и других членистоногих. Эти сегменты он смело гомологизирует с позвонками и заявляет: «Насекомые живут внутри своего позвоночного столба, как моллюски в своей раковине» («Considerations generales sur la vertebre», стр. 99). Он развивает эту мысль и делает 5 основных выводов из этого «открытия». Так, первый, основанный на «принципе уравновешения», гласит, что толщина «кольца» (т. е. «позвонка») или массивность его находится в обратном отношении к его окружности и т. д.
Жоффруа как будто не замечает, что его утверждение о том, что все внутренние органы (кишечник, кровеносная система и т. д.) помещаются внутри позвоночного столба, находится в прямом противоречии с его основным принципом взаимосвязи, ибо у позвоночных эти системы органов  находятся   вне   позвоночника.
Однако Жоффруа идет еще дальше. Он гомологизирует верхнюю и нижнюю дугу позвонков совместно с их придатками с конечностями насекомого. На рисунках он обозначает гомологичные части теми же буквами (см. рисунок). «Я сравниваю, — пишет он, — части, располрженные вертикально, придатки позвонков рыб, с удлиненными частями с боков и расположенными горизонтально частями, которые называются энтомологами, в зависимости от функции. .., у десятиногих раков истинными и ложными ножками» (там же, стр. 106). Предвидя в этом случае возможное возражение на основании принципа взаимосвязи, Жоффруа пишет: «Такое возражение по существу не реально. Случается, говорю я, когда исключения, правильно оцененные, только служат в пользу правила. Так, неправильные движения луны, благодаря научному объяснению их, стали одним из неопровержимых доказательств системы мира, тогда как Ньютон в них видел досадное противоречие этой системе» (там же, стр. 106). И дальше Жоффруа пытается показать, что положение по отношению к земной поверхности, разное у вертикальных плавников и горизонтальных «ножек», не находится в противоречии с «принципом взаимосвязи», хотя, конечно, противоречие с этим принципом заключается не в этом, а в совершенно необоснованной гомологизации столь различных частей, как придатки позвонка и конечности насекомого.